【BioInfo】分子時計とは?

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分子時計とは、進化の過程で遺伝子やタンパク質の配列に起こる変異の蓄積速度を基にして、生物の進化の時間的なスケールを推定する手法です。生物の遺伝情報に変異が蓄積される速度は、特定の遺伝子やタンパク質において一定の割合で進行すると考えられ、これを「時計」として使うことから、「分子時計」と呼ばれます。

分子時計の基本的な考え方

進化の過程で、ある遺伝子やタンパク質の配列には自然に変異が生じます。これらの変異の蓄積速度が比較的安定していると仮定すれば、二つの生物がどれだけ前に共通の祖先から分岐したかを推定できます。分子時計は、この変異の蓄積率を「時間の指標」として使い、進化の分岐点や種分化の時期を測ることができます。

分子時計の使用例

分子時計は、以下のような生物学的研究に使われます。

  • 系統樹の作成
    分子時計を使うことで、異なる種がどの時点で共通の祖先から分岐したのかを推定し、進化の系統樹を構築します。
  • 種分化の時期の推定
    化石記録だけでは不十分な場合でも、分子時計を使うことで、化石が発見されていない生物の種分化の時期を推定できます。
  • 進化の速度の比較
    異なる遺伝子やタンパク質の進化速度を比較することで、進化の過程における圧力や適応の違いを調べることができます。

分子時計のメリット

  • 進化の時間スケールを推定できるため、化石記録が不十分な場合でも進化の歴史を追うことができる。
  • 遺伝子やタンパク質の配列データがあれば、比較的簡単に進化の時間を推定できる。

分子時計の限界

分子時計にはいくつかの課題や限界もあります。

  • 変異速度が一定でない場合がある
    すべての遺伝子が同じ速度で変異するわけではなく、進化のスピードは環境や自然選択の影響を受けて変わることがあります。このため、正確な推定が難しい場合もあります。
  • 時間の精度に限界がある
    遺伝子ごとに変異速度が異なるため、分子時計が示す進化の時間が常に正確とは限らないことがあります。

まとめ

分子時計は、生物が進化の過程でどれだけの時間が経過したかを推定するための便利な手法です。遺伝子やタンパク質の変異速度に基づき、進化の系統や種分化の時期を明らかにするのに役立ちますが、変異速度が一定でないことや環境要因の影響に注意が必要です。それでも、化石記録の不足を補う方法として、進化生物学において広く使われています。

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